I mörkret är en nervkittlande och känsloladdad spänningsroman där vi åter får möta utredaren Sofia Hjortén och den avhoppade polisaspiranten Fredrik Fröding.

En fyraårig flicka har försvunnit från sitt hem och snart upptäcks att fler familjemedlemmar saknas. Tiden tickar för den försvunna flickan, och Sofia och hennes kollegor söker desperat i ett snötäckt Örnsköldsvik.

Samtidigt brottas den höggravida Sofia med känslomässiga problem. Fredrik har inlett ett förhållande hemma i Stockholm och hon själv väntar barn med en annan man. I bakgrunden finns Fredriks kamp mot PTSD, längtan efter att återuppta poliskarriären och den aldrig bleknande tanken på att hans bror Niklas faktiskt kan ha överlevt Estoniakatastrofen.